Studie a analýza rezistencí
Jak spustit výpočty:
Spouštěcí ikonku na výpočet rezistencí nalezneme mezi Sestavy, podobně jako Hemokultury, EARSS apod.
Co je třeba si napřed uvědomit:
Rezistence se studují na bázi kmenů a ne na bázi celé sekvence vzorků. Ve standardní podobě jsou vstupními parametry pro studii následující údaje:
Oddělení (nákladové středisko)
Datum od
Datum do
Několik skupin mikrobů
Pro každou z těchto skupin vytipovanou sestavu relevantních antibiotik
Pro výpočet se uvažují vždy jenom a právě první výskyty u daného pacienta v daném období, neuvažují se tedy opakované izoláty. V tom je také
výpočet nejsložitější.
Jak je možno studie chtít upravit:
Skupiny patogenů je možno upravit - je to pouze výčet zkratek, které jaksi logicky patří k sobě, protože se stdudují jako celek.
Sestavy antibiotik je možno také pro každou skupinu redefinovat.
V principu je možno zgrupovat několik oddělení do jedné skupiny, ale není to doporučení hodný postup, protože to zkreslí výsledky.
První výskyty je možno chtít cíleně studovat podle konkrétních materiálů nebo jejich skupin, tedy DCD zvlášť apod.
Poznámka pro VFN:
Pro studie se uvažují kmeny, které dorazí na ATB středisko a vychází se z MIC. Jedná se tedy o laboratoř X.
Je možno získat i analogické výsledky pro ostatní laboratoře, tam pak na základě diskové citlivosti.
Příklad analytické sestavy rezistencí - data jsou anonymizovaná:
=========================================================================================================
Analýza rezistencí pro oddělení 220XX v období 01.01.2006 - 31.12.2006
************************************************************************
Dvojčíslí v tabulkách ve tvaru R:T reprezentuje vždy dvojici, R je počet rezistentních a
T je počet testovaných. Je tedy za podmínky T<>0 zlomek rovnou podílem rezsitentních.
Analýza probíhá pouze přes první výskyty daného kmene v rámci každého pacienta na daném
oddělení v daném období. Opakované izoláty stejného kmene u stejného pacienta se tedy ignorují.
Pozor - pro analýzu se uvažují vzorky, které prošly ATB střediskem, tedy laboratoří X.
---------------------------------------------------------------------------------------------------------
=========================================================================================================
220XX 20060101-20061231 ST*
---------------------------------------------------------------------------------------------------------
Mikrob OXA GEN CIP ERY CLI RIF VAN COT CMP TET
---------------------------------------------------------------------------------------------------------
STAG 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1
STAU 0:9 0:9 0:9 0:9 0:9 0:9 0:9 0:9 0:9 0:9
STEP 5:7 5:7 5:7 5:7 0:7 1:7 0:7 5:7 2:7 0:7
STHA 3:5 3:5 3:5 3:5 0:5 0:5 0:5 2:5 0:5 0:5
STMA 0:5 0:5 1:5 0:5 0:5 2:5 0:5 0:5 3:5 0:5
---------------------------------------------------------------------------------------------------------
=============================================
220XX 20060101-20061231 EKFE,EKFC
---------------------------------------------
Mikrob AMP GEN STR VAN
---------------------------------------------
EKFE 0:0 0:0 0:0 0:0
EKFC 0:0 0:0 0:0 0:0
---------------------------------------------
===================================================================================================================================================================================================
220XX 20060101-20061231 ESCO,KLPN,KLOX,ENCL,ENAE,PRMI,PRVU,MGMO,SEMA,CIFR,SAEN,SATM,ATSP,PSCE,XAMA,NFT
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Mikrob AMP AMC PIP PPT CLT CRX CXT CTX CTZ CRM AZT IMI GEN AMI OXO OFL CIP COT COL
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ESCO 8:21 0:21 0:21 0:21 0:21 5:21 0:21 1:21 1:21 0:21 0:21 0:21 1:21 0:21 0:21 7:21 7:21 4:21 0:21
KLPN 10:18 0:18 0:18 0:18 0:18 9:18 0:18 9:18 9:18 0:18 0:18 0:18 6:18 1:18 0:18 9:18 9:18 7:18 0:18
KLOX 3:5 0:5 0:5 0:5 0:5 3:5 0:5 1:5 1:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 1:5 1:5 2:5 0:5
ENCL 1:5 0:5 0:5 0:5 0:5 1:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5
ENAE 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0
PRMI 1:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 0:5 1:5 0:5 0:5 1:5 1:5 1:5 1:5
PRVU 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1 0:1
MGMO 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0
SEMA 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0
CIFR 2:3 0:3 0:3 0:3 0:3 2:3 0:3 1:3 1:3 0:3 0:3 0:3 0:3 0:3 0:3 0:3 0:3 0:3 0:3
SAEN 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0
SATM 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0
ATSP 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0
PSCE 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0
XAMA 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0
NFT. 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
===========================================================================
220XX 20060101-20061231 PSAE
---------------------------------------------------------------------------
Mikrob PIP CTZ IMI GEN AMI CIP COL
---------------------------------------------------------------------------
PSAE 0:29 9:29 0:29 8:29 1:29 11:29 0:29
---------------------------------------------------------------------------
====================================================
220XX 20060101-20061231 SPPY,SPAG,SPBT,SPPN
----------------------------------------------------
Mikrob PEN ERY CLI
----------------------------------------------------
SPPY 0:0 0:0 0:0
SPAG 0:0 0:0 0:0
SPBT 0:0 0:0 0:0
SPPN 0:0 0:0 0:0
----------------------------------------------------
====================================================
220XX 20060101-20061231 HEIN
----------------------------------------------------
Mikrob AMP COT CMP TET
----------------------------------------------------
HEIN 0:0 0:0 0:0 0:0
----------------------------------------------------
Index
