JLABS

JLabs.MBIO-VFN.SetUp

Iniciální podklady pro přizpůsobení generické konfigurace


Bullet Seznam laboratoří. Ke každému písmenku v abecedě přísluší určitá část provozu. Dělení může odpovídat odbornému hledisku, může být zaměřeno na interní/externí klientelu apod. Obvykle jsou obsazena písmenka těmito defaulty: K - konzultace, M - mykologie, S - serologie, T - TBC, V - virologie.


Bullet Seznam biologických materiálů. Doporučuje se zůstat u defaultní konfigurace a tu případně za provozu obohatit o ty materiály, které defaultní konfigurace neobsahuje. Bude jich minimum a pro začátek je možno vybírat nejpodobnější materiál.


Bullet Seznam výkonů účtovaných za zpracování materiálů na bakteriologii. Jsou to ty výkony, které budou vyúčtovány vždy z toho titulu, že odpovídají technologii zpracování. Další výkony budou případně vyúčtovány již cíleně s ohledem na prováděná vyšetření, testy, stanovení citlivostí apod. Zde se jedná o defaulty vyúčtované i kdyby se nic jiného než zpracování materiálu nedělalo. Doporučuje se ponechat defaulty a zkontrolovat je.


Bullet Seznam bakteriologických vyšetření. Tedy věci jako MOP, Aerobní kultivace, Anaerobní kultivace, Meningokoky kultivace apod. Jsou to ucelené úkony, které se samostatně dostanou do výsledku ve vlastní sekci a také se samostatně vyúčtují. Doporučuje se ponechat defaulty a zkontrolovat je.


Bullet Seznam serologických a virologických metod. U těch, které obsahují de-facto několik testů, uvést každý test a také jak se má účtovat. Do výsledků jdou metody každá ve vlastní sekci, každá může mít jinak strukturovaný výsledek.


Bullet Pro řádově čtyři materiály, konkrétně absces-hnis, krev, moč a mok, udělat podklady na mustr, který se má zobrazit v grafickém zápise jako základní default odvozený z faktu, že se zpracovává uvedený resp. podobný materiál. Doporučuje se použít defaulty a ty pak stratifikovat. Jedná se o sekvence typu Primokultura,Mikroskopie,Půda A,Půda B,Pomnožení,Půda C,Půda E,... Podobné mustry naznačit i pro bakteriologická vyšetření.


Bullet Seznam používaných půd, jejich zkratky a mají-li nějakou specifickou barvu, pak i tu, aby jim odpovídající razítka v knize měla podobnou.


Bullet Pro každou laboratoř nebo případně separátně pro bakterku, serologii a tbc dát pokyny, na jaké horké klávesy je třeba navěsit jaké akce. Je možno vyjít z defaultů. Cílem je, aby obsluha v dané laboratoři měla co možná nejrychlejší cestu k frekventovaným zápisům. Pakliže třeba na TBC je častým úkonem otisknutí razítka "Negativní", vyplatí se vybrat klávesu, třeba Alt+N, kterou se zapis provede.


Bullet Zrevidovat údaje, které databáze má u každého vzorku. Ne nutně všechny potřebujete, defaultní verze obsahuje raději více než méně.


Bullet Úpravy konfigurace se typicky dělají z JLabs on-line, jenom ty iniciální jsou trochu složitější, protože vaše laboratoř má různé zažité obraty a zvyky.


Bullet Sestavy citlivostí. U diskové citlivosti zvolit, zda se bude evidovat i průměr zóny nebo ne. To je možno nakonec změnit i posléze. U každé požadované sestavy dát vektor použitých antibiotik podle zkratek a případně i preferenci, zda se má jednat o například dva sloupečky po osmi nebo jeden dlouhý sloupeček. Razítka mohou vypadat analogicky, jako různé testovací sady apod. Rozhodnete-li se pro evidenci průměrů zóny, nutno u každého antibiotika dát i breakpoint. U MIC rovněž, tam se naznačuje i iniciální koncentrace, kterou řada ředění pro dané antibiotikum začíná.

Složité zónové razítko:

    Disková citlivost stafylokoky - varianta se zónami
    AMC=5,CMP=6,COT=7,ERY=8,LIN=9,GEN=10,OXA=11,CLT=12,TET=13,OFL=14,FUR=15
    CIP=20,CTX=20,CXT=20,CLI=20,SPI=20,VAN=20,IMI=20,SCF=20
    BAC=11,NEO=11,RIF=11,AMI=12,TZP=9,MUP=17
    FR1,Fr2,FR3,FR4,FR5,FR6

    Komentář:
        První řádek definuje nápis, tedy shrnutí toho, co to vlastně je za razítko
        Druhý až čtvrtý řádek každý definují sloupec v sestavě. Vždy to je zkratka antibiotika a za rovnítkem
        breakpoint.
        Pátý řádek říká, že chceme nechat ještě šest volných kolonek na dopisování antibiotik z ruky. Tam se žádný
        breakpoint neudává, protože nevíme dopředu, jaké antibiotikum tam případně doplníme.

Složité MIC razítko:
    serie3=AMP,AMS,CZL,CRX,CXT,CTX,CPR,CMP,TET,COT,TRI,FUR
    atb=AMP,,6,2
    atb=AMS,,6,3
    atb=CZL,,6,2
    atb=CRX,,6,2
    atb=CXT,,6,2
    atb=CTX,,4,2
    atb=CPR,,5,3
    atb=CMP,,6,2
    atb=TET,,6,1
    atb=COT,,7,5
    atb=TRI,,4,0
    atb=FUR,,7,5
    serie3=PIP,PPT,CTZ,CPM,GEN,NET,AMI,COL,OXO,CIP,MER,AZT
    atb=PIP,,6,4
    atb=PPT,,6,4
    atb=CTZ,,4,2
    atb=CPM,,4,1
    atb=GEN,,5,2
    atb=NET,,5,2
    atb=AMI,,6,3
    atb=COL,,6,2
    atb=OXO,,5,3
    atb=CIP,,4,0
    atb=MER,,4,2
    atb=AZT,,5,3
    column=25
    line=3
    next=FR1
    serie3.free=FR1,FR2,FR3,FR4,FR5,FR6
 
Vzhledem k tomu, že sestav není ohromující množství, uděla JLabs podle aspoň trochu srozumitelných podkladů všechny iniciálně nutné sestavy a časem se pak již dají odklonováním z podobných dělat další. Je důležité vědět, že breakpointy jsou lokální vůči dané sestavě. Třeba proto, že se jedná o testy určené na stafylokoky apod.
Bullet Iniciální konfigurace je práce na řádově dva týdny občasné interakce mezi laboratoří a JLabs. Konfiguruje se nakonec několik tisíc parametrů a bez iterativního postupu to nejde. Dobré je "rozvrtanou" konfiguraci průběžně používat na cvičný provoz, protože jenom tak se mohou vykrystalizovat názory laboratoře na takové jemnosti, jako je obsazení horkých kláves, chod kurzoru po sestavách antibiotik apod. Tato práce se ale bohatě zaplatí, protože u laboratoře zpracovávající denně až tisíc vzorků je každá ušetřena vteřina na práci s jedním ekvivalentní denně hodinám volného nebo ztraceného času (každý vzorek má s pomocí počítače v ruce hned několik lidí několikrát).


Bullet Index


JLABS Aktualizováno dne 20050719. Komentář: info@jlabs.cz